Após 500 anos de danos, exploração dos recursos hídricos, minerais, vegetais e humanos, a bacia hidrográfica do rio São Francisco sofre sérios impactos ambientais, e esses impactos estão diretamente ligados à atividade econômica desenvolvida em cada região.
No Baixo São Francisco, a preocupação maior é com a regularização do fluxo de água. Esse fluxo sofre com as mudanças ocorridas no percurso em que corre, por causa do uso excessivo e descontrolado das águas. As barragens feitas ao longo do rio provocam um processo irreversível de assoreamento, já que diminuem a correnteza natural, formam bancos de areia e transformam drenos naturais de água em áreas pantanosas. Além disso, afetam a atividade pesqueira e a cultura do arroz da população ribeirinha.
A primeira medida é a conscientização da população para que o lixo não seja jogado nos rios. Outra medida importante é a ação de projetos de manutenção dos rios, através do processo de desassoreamento. Todas as sub-regiões da Bacia Hidrográfica do rio São Francisco precisam ser preservadas e revitalizadas com urgência e o Velho Chico conta com a participaçao efetiva de todos que utilizam das suas águas.